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Meld
Nachdem ich alle möglichen Tools ausprobiert habe (z.B. KDiff, xxdiff, tkdiff usw.), bin ich letzten Endes bei "Meld" gelandet. Das in Python geschriebene Programm ist recht übersichtlich gestaltet und kommt mir nicht so überfrachtet vor, wie einige der anderen getesteten Tools.
Die Unterschiede werden in Farbe dargestellt und das sogar auf Buchstabenebene. Auch Verzeichnisse lassen sich vergleichen.
Screenshot
Homepage/Download:
http://meld.sourceforge.net